Поиск информации в Uniprot о белке Beta-galactosidase BgaB в Uniprot


Таблица1.Beta-galactosidase BgaB
UniProt ID BGAL_BIFAA
UniProt AC A1A399; Q5J883
RefSeq ID WP_041777416.1
PDB ID 5VYM
Длина (амин.ост.) 700
Молекулярная масса (Да) 78025
Рекомендуемое Uniprot название Beta-galactosidase BgaB


Комментарий к таблице1.

Согласно данным полученным с сайта Uniprot, белок Beta-galactosidase BgaB ,первое упоминание о котором относится к 3 марту 2011 года, характерен для организма Bifidobacterium adolescentis. Данный белок состоит из 2 полипетидных цепей с суммарным весом 78025 Да, в которых содержится 700 амикокислотных остатков. По данным Uniprot степень достоверности 1, из чего можно заключить, что выявлены эксперементальные доказательства его существования. Этот белок включен в гидролиз TOS. Оптимум активности достигается при рН 6.0 и температурах 50 и 35 С в зависимости от условий реакции.



Таблица2.кластеры Beta-galactosidase BgaB
Uniref Cluster ID Cluster name Size
Uniref100 UniRef100_A1A399 Beta-galactosidase BgaB 2
UniRef90 UniRef90_A1A399 Beta-galactosidase BgaB 13
UniRef50 UniRef100_Q7AKG8 Beta-galactosidase BgaB 152


Результаты сеансов поиска в Uniprot

Поиск по белку Beta-galactosidase BgaB

1) Среди всех организмов.

Текст запроса: name:"Beta-galactosidase BgaB"

Сколько белков: 47

Сколько из раздела Reviewed: 4

ссылка

2) В исходном организме.

Текст запроса: name:"beta galactosidase bgab" organism:"bifidobacterium adolescentis strain atcc 15703 dsm 20083 nctc 11814 e194a"

Сколько белков: 1

Сколько из раздела Reviewed: 1

ссылка

3) Среди семейства организма (bifidobacteriaceae)

Текст запроса: name:"beta galactosidase bgab" taxonomy:bifidobacteriaceae

Сколько белков: 2

Сколько из раздела Reviewed: 1

ссылка

4) Среди отдела организма (Actinobacteria).

Текст запроса: name:"beta galactosidase bgab" taxonomy:actinobacteria

Сколько белков: 10

Сколько из раздела Reviewed: 1

ссылка

Поиск по лизоциму

1) Среди всех организмов

Текст запроса: name:lysozyme

Сколько белков: 24247

Сколько из раздела Reviewed: 239

ссылка

2) Среди Metazoa

Текст запроса: name:lysozyme taxonomy:Metazoa

Сколько белков: 2246

Сколько из раздела Reviewed: 158

ссылка

3) Среди бурых грибов

Текст запроса: name:lysozyme taxonomy:fungi

Сколько белков: 293

Сколько из раздела Reviewed: 2

ссылка

Поиск по трипсину

1) По слову "трипсин".

Текст запроса: name:trypsin

Сколько белков: 18951

Сколько из раздела Reviewed: 311

ссылка

2) Ингибиторы.

Текст запроса: name:trypsin name:inhibitor

Сколько белков: 3914

Сколько из раздела Reviewed: 210

ссылка