Геномные браузеры

Задание 1.

1. Pepsin A-3 (PGA3)
2.Закодирован на прямой цепи
3. Находитяся на 11 хромосоме
4. chr11:q12.2
5.chr11:61,203,640-61,212,996
6. По GENECODE 3 альтернативных продукта.
7. 1)ENST00000325558.10 : число экзонов - 9, длина белка - 388 аа
2)ENST00000543125.5 : число экзонов - 4, длина белка - 234 аа
3)ENST00000538258.1 :число экзонов - 3, длина белка - 128 аа

Задание 2.

Было построено выравнивание выбранного гена человека (PGA3) с гомологичным геном шимпанзе. Результат: ali.fasta
Сравнение генов программой dismat пакета EMBOSS:

Distance Matrix
---------------

Uncorrected for Multiple Substitutions
Using base positions 123 in the codon
Gap weighting is 0.000000

            1       2
          0.00    4.89          homo_sapiens_1-10185 1
                  0.00          pan_troglodytes_1-10185 2