В следующем файле приведены 6 выравненных последовательностей

Первые две последовательности были получены путем выравнивания 5 гомологичных белков программой "muscle", из которого было взято ровно 2 последовательности. 3 и 4 последовательности были получены программой "needle", а 5 и 6 - "water". Интересно, что в виду большой гомологии белков глобальное и локальные выравнивания получились одинаковами.

Что касается отличий, то начиная с 5 колонки, видны различия. В певой группы выравниваний в 5 колонке под А стоит Е, а в двух других гэп вместо А. Для 1 группы L6 гомологичен L15(19 колонка), а в других группах L6 гомолгичен L9 (9 колонка),для первой группы в 25 колоке стоят гомологичные Q, для двух других варавниваний Q13 и Q21 не гомологичны.

Вторые две группы варавиваний кажутся более правдоподобными, во-первых, потому что выше процент сходства, а во-вторых, для двух разных программ одинаковый результат.