DPO3X_ECOLI

Полное название белка: DPO3X_ECOLI

Краткое название белка: PO6710

Полное название организма: Escherichia coli, K-12

Название гена: dna X

Номер локуса в бактериальной хромосоме: b0470

Последовательность в формате FASTA:

>DPO3X_ECOLI b0470
MSYQVLARKWRPQTFADVVGQEHVLTALAN
GLSLGRIHHAYLFGTRGVGKTSIARLLAKG
LNCETGITATPCGVCDNCREIEQGRFVDLI
EIDAASRTKVEDTRDLLDNVQYAPARGRFK
VYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEHVK
FLLATTDPQKLPVTILSRCLQFHLKALDVE
QIRHQLEHILNEEHIAHEPRALQLLARAAE
GSLRDALSLTDQAIASGDGQVSTQAVSAML
GTLDDDQALSLVEAMVEANGERVMALINEA
AARGIEWEALLVEMLGLLHRIAMVQLSPAA
LGNDMAAIELRMRELARTIPPTDIQLYYQT
LLIGRKELPYAPDRRMGVEMTLLRALAFHP
RMPLPEPEVPRQSFAPVAPTAVMTPTQVPP
QPQSAPQQAPTVPLPETTSQVLAARQQLQR
VQGATKAKKSEPAAATRARPVNNAALERLA
SVTDRVQARPVPSALEKAPAKKEAYRWKAT
TPVMQQKEVVATPKALKKALEHEKTPELAA
KLAAEAIERDPWAAQVSQLSLPKLVEQVAL
NAWKEESDNAVCLHLRSSQRHLNNRGAQQK
LAEALSMLKGSTVELTIVEDDNPAVRTPLE
WRQAIYEEKLAQARESIIADNNIQTLRRFF
DAELDEESIRPI

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав

А(аланин) 13,3%
С(цистеин) 7,3%

D(аспарагиновая кислота) 2,8%

Е(глутаминовая кислота) 8,2%

F(фенилаланин) 1,8%

G(глицин) 3,7%

Н(гистидин) 2,5 %

I(изолейцин) 4,2%

К(лизин) 4,3%

L(лейцин) 12,2%

М(метионин) 2,3%

N(аспарагин) 2,8%

Р(пролин) 6,3%

Q(глутамин) 6,2%

R(аргинин) 7,3%

S(серин) 4,6%

Т(треонин) 5,7%

V(валин) 6,6%

W(триптофан) 0,93%

Y(тирозин) 1,4%

Длина последовательности: 644 а.о.
Молярная масса: 71276,31 г/моль.
Средний заряд молекулы: -2,98 при рН=7; 137,007 при рН=1.
Отношение содержания гидрофобных остатков (фенилаланин, валин,аланин, цистеин, изолейцин, лейцин, метионин) к содержанию гидрофильных (аспарагин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, гистидин, лизин, серин, аргинин, глутамин) - 1.236. Таким образом, белок не является мембранным.

©Лавыш Дарья