| Почему был выбран для секвенирования генома? |
Эта морская бактерия обитает в прибрежных зонах океана. Определенные биологические свойства прибрежных бактерий дифференцируют их от их открыто-океанских родственников.
Silicibacter pomeroy катализатор большинства главных биогеохимических процессов в море. Она способна разлагать органические соединения серы (диметилсульфониопропионат), и может метаболизировать множество соединений серы. Диметилсульфид вносит свой вклад в глобальный цикл серы. Различные биологические особенности могут сказать нам о региональных различиях в круговороте вещества и энергии. Анализ обеспечит получить более точное представление о круговороте серы в мировом океане.
|
Плоды цитрусовых-очень важный продукт для экономики многих стран. В последнее время цитрусовые деревья подвержены влиянию вредителей, изменений окружающей среды, химических препаратов. Все виды цитрусовых развиваются как привой на корневище другого растения, поэтому плоды существенно отличаются от плодов, выращенных естественным путем. Прививку используют так как сегодня есть сложности для естественного культивирования: долгий период роста до плодоношения, проблемы, связанные с межвидовым скрещиванием.
Поэтому геном Citrus sinensis даст уникальную информацию для культивирования всех многолетних древесных растений. |
| Дополнительные сведения |
Известен уже полный геном данного организм
Размер: 4 Mbp;
Сравним размеры генома данного организма с размерами генома человека (примерно 3500 Mbp , Mbp - единица измерения "длины" генома, 1 миллион нуклеотидов)
4: 3500=0,0012 меньше генома человека в 0,0012 раз
геном Silicibacter pomeroyi меньше генома человека в 0,0012 раз
Оценим степень родства Silicibacter pomeroyi с Escherichia coli K-12.
Silicibacter pomeroyi: Бактерия; Протеобактерия;Альфа-протеобактерия; Rhodobacterales; Silicibacter; Silicibacter pomeroyi DSS-3
Escherichia coli K-12 относиться к классу гамма-протеобактерий,а Silicibacter pomeroyi к классу Альфа-протеобактерий. Следовотельно, данные организмы принадлежат только к одной группе - являются далекими родственниками. источник информации о Silicibacter pomeroyi
|
Геном находится на стадии проекта. Предполагается, что его размер будет примерно 380 Mbp
Сравним размеры генома данного организма с размерами генома человека (примерно 3500 Mbp , Mbp - единица измерения "длины" генома, 1 миллион нуклеотидов)
380: 3500= 0,109
Геном Citrus sinensis меньшне генома человека в 0,109 раз. источник информации о Citrus sinensis
|
Первый
Семестр
