С помощью функции <СРЗНАЧ> Excel были найдены значения средних весов замен между разными аминокислотами:
в группе NDEQ среднее значение = 0,83.
в группе MILV среднее значение = 1,6.
И между этими двумя группами среднее значение = –2,56.
Внутри группы вес замен велик. Между группами напротив, вес замен имеет отрицательное значение. Следовательно, группы сильно различаются по свойствам (NDEQ — гидрофильные и
полярные, а MILV — гидрофобные и неполярные).
Из базы данных выбрала самый широкий блок.
С помощью программы pairs_count.exe получила таблицу количеств различных пар аминокислот в блоке.
Рассчитала веса аминокислотных замен для трёх аминокислот: Ala, Val, Asp.
Рассчитала частоту выбранных пар аминокислот в данном блоке. Вес замены аминокислот в парах AA, AD, AV были посчитаны по формуле:
частота встречаемости пары/(частота встречаемости первой аминокислоты*частота
встречаемости второй аминокислоты).
Второй Семестр