Второй семестр

Поиск по паттерну в банке Swiss-Prot.

Результаты поиска в последовательности моего белка всех мотивов, описанных в PROSITE.

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль, правило) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST]-x(2)-[DE] неспецифична 12
PS00008 MYRISTYL сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 7
PS00017 ATP_GTP_A Мотив АТФ/ГТФ-связывающего сайта (P-петля) паттерн [AG]-x(4)-G-K-[ST] неспецифична 1
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования тирозинкиназы паттерн [RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Yor[RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y неспецифична 1
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования протеинкиназы C паттерн [ST]-x-[RK] неспецифична 6
PS00009 AMIDATION сайт образования амидной связи паттерн x-G-[RK]-[RK] неспецифична 1

©Лавыш Дарья