Второй семестр

Доменная структура белка DPO3X_ECOLI.

  1. В Pfam нашла описание доменной структуры моего белка по AC (P06710).

    схематическое изображение полной доменной структуры по данным Pfam. положение доменов в 3D-структуре моего белка. Код белка в банке PDB-1njf.
  2. Описание доменов:

    Идентификатор Pfam
    Название записи
    Полное название домена
    Положение в последовательности хххх_Ecoli
    PF00004
    AAA
    АТФаза,отвечающая за различные клеточные активности.
    40-230
    PB004020
    Pfam-B_1431
    -
    240-358
    PD581402
    Pfam-B_3460
    -
    521-642

    Подробное описание домена PF00004

    1. Домены данного семейства часто выполняют функцию помошников в сборке или разрушении белковых комплексов.
    2. Всего известно 6082 белка с доменами AAA.
    3. Белки с такими доменами встречаются в следущих таксонах:
      4. Таксон
      Количество белков с доменом PF00004.
      Эукариоты Растения  0
      Грибы  648
      Животные  729
      Бактерии    2235
      Археи    204
      Остальные таксоны  3816
    4. Ответы на вопросы:
      • Домен ххх всегда встречается в белках в сочетании с другими доменами.
      • Встречается дупликация домена ААА, но довольно редко, в одном белке есть пентапликация.
      • Домен ААА встречается в белках с разными доменами,белков с дааным доменом достаточно много, расположения доменов очень разнообразны.
    ©Лавыш Дарья