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# Program:  needle
# Rundate:  Sun Apr 15 20:52:18 2007
# Align_format: srspair
# Report_file: /ebi/extserv/old-work/needle-20070415-20521724605356.output
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# Aligned_sequences: 2
# 1: AT2A1_RABIT
# 2: SEQUENCE
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1001
# Identity:     993/1001 (99.2%)
# Similarity:   993/1001 (99.2%)
# Gaps:           7/1001 ( 0.7%)
# Score: 5108.0
# 
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AT2A1_RABIT        1 MEAAHSKSTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRHLEKYGHNELPAEEGKSLW     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE           1 MEAAHSKSTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRHLEKYGHNELPAEEGKSLW     50

AT2A1_RABIT       51 ELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE          51 ELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIA    100

AT2A1_RABIT      101 NAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDI    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         101 NAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDI    150

AT2A1_RABIT      151 VEVAVGDKVPADIRILSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVPDPRAV    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         151 VEVAVGDKVPADIRILSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVPDPRAV    200

AT2A1_RABIT      201 NQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVSTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQ    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         201 NQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVSTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQ    250

AT2A1_RABIT      251 QKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         251 QKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV    300

AT2A1_RABIT      301 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICS    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         301 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICS    350

AT2A1_RABIT      351 DKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDFCSLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDK    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         351 DKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDFCSLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDK    400

AT2A1_RABIT      401 PIRSGQFDGLVELATICALCNDSSLDFNETKGVYEKVGEATETALTTLVE    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         401 PIRSGQFDGLVELATICALCNDSSLDFNETKGVYEKVGEATETALTTLVE    450

AT2A1_RABIT      451 KMNVFNTEVRNLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSP    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         451 KMNVFNTEVRNLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSP    500

AT2A1_RABIT      501 AKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPMTGPVKEKILSVIK    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         501 AKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPMTGPVKEKILSVIK    550

AT2A1_RABIT      551 EWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSSRFMEYETDLTFVGVVGML    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         551 EWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSSRFMEYETDLTFVGVVGML    600

AT2A1_RABIT      601 DPPRKEVMGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVAD    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         601 DPPRKEVMGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVAD    650

AT2A1_RABIT      651 RAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAM    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         651 RAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAM    700

AT2A1_RABIT      701 TGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEG    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         701 TGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEG    750

AT2A1_RABIT      751 RAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTD    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         751 RAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTD    800

AT2A1_RABIT      801 GLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVGAATVG    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         801 GLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVGAATVG    850

AT2A1_RABIT      851 AAAWWFMYAEDGPGVTYHQLTHFMQCTEDHPHFEGLDCEIFEAPEPMTMA    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         851 AAAWWFMYAEDGPGVTYHQLTHFMQCTEDHPHFEGLDCEIFEAPEPMTMA    900

AT2A1_RABIT      901 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLMRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYV    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SEQUENCE         901 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLMRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYV    950

AT2A1_RABIT      951 DPLPMIFKLKALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFIARNYLEDPEDERR   1000
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.      
SEQUENCE         951 DPLPMIFKLKALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFIARNYLEG          994

AT2A1_RABIT     1001 K   1001
                      
SEQUENCE         995      994


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