Практикум №8. Нуклеотидный BLAST
Поиск δ-субъединицу АТФ-синтазы
В данном задании исследовался геном и протеом коралла Acropora millepora.
С помощью текстового поиска в файле протеома была найдена последовательность δ-субъединицы АТФ-синтазы. В качестве запроса были заданы слова "subunit delta".
Файл с последовательностью белка atpase_sub_delta.fasta
Далее бклок был найден в NCBI Protein Database, откуда был взят идентификатор нуклеотидной записи, к которой относится ген, кодирующий данный белок: NC_058079.1
Файл с последовательностью гена и его окружением nucleotide_seq_atpase.fasta
Координаты гена: 4438820-4443480
Рис 1. Окружение гена.