Для построения HMM-профиля было выбрано семейство Aminotransferase class I/II (Pfam AC: PF00155). Белки этого семейства являются пиридоксаль-5'-фосфат (PLP)-зависимыми ферментами и катализируют широкий спектр реакций трансаминирования, участвуя в метаболизме аминокислот, биосинтезе вторичных метаболитов и других процессах. Последовательностей в seed и full — 48 и 171 269 соответственно.
Далее было выбрано подсемейство с доменной архитектурой PF03744 - PF00155. Всего было найдено 32 таких белка.
Белковые последовательности этого подсемейства были выравнены алгоритмом MAFFT для создания HMM-профиля.