Учебный сайт Фоменко Елены
Главная | Семестры | Проекты | Заметки |
Название двугранного угла | Угол определяется по координатам атомов (обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol, в скобках – название атома) | Данный угол описывает поворот вокруг связи | Результат измерения с помощью RasMol |
φ | 1. LEU11:A.C (карбонильный углерод 11-го остатка цепи А) 2. LYS12:A.N (атом азота 12-го остатка цепи А) 3. LYS12:A.CA (атом Calpha 12-го остатка цепи А) 4. LYS12:A.C (карбонильный углерод 12-го остатка цепи А) |
N12 - Calpha12 | -66, 83 |
ψ | 1. LYS12:A.N (атом азота 12-го остатка цепи А 2. LYS12:A.CA (атом Calpha 12-го остатка цепи А) 3. LYS12:A.C (карбонильный углерод 12-го остатка цепи А) 4. ASP13:A.N (атом азота 13-го остатка цепи А) |
Calpha12 - С13 | -42.64 |
ω | 1. LYS12:A.CA (атом Calpha 12-го остатка цепи А) 2. LYS12:A.C (карбонильный углерод 12-го остатка цепи А) 3. ASP13:A.N (атом азота 13-го остатка цепи А) 4. ASP13:A.CA (атом Calpha 12-го остатка цепи А) |
C12 - N13 | 179.85 |
Изображение, иллюстрирующее определение угла φ
Изображение можно получить с помощью скрипта
1)Для всех остатков белка
2)Для всех остатков пролина
3)Для всех остатков глицина
4)Для всех остатков в альфа-спиралях
5)Для всех остатков в бета-листах