Учебный сайт Фоменко Елены

Главная

Семестры

Проекты

Заметки

Предстоит поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий. На следующих занятиях это дерево будет сравниваться с реконструкциями филогении по последовательностям белков. Выбрала следующий список бактерий:

Название	Мнемоника
Bacillus subtilis	BACSU
Enterococcus faecalis	ENTFA
Finegoldia magna	FINM2
Geobacillus kaustophilus	GEOKA
Lactobacillus delbrueckii	LACDA
Listeria monocytogenes	LISMO
Staphylococcus aureus	STAA1
Streptococcus pyogenes	STRP1

Дано дерево:

На основе него составила дерево выбранных 8 бактерий.

Скобочная формула:
(FINM2,((LACDA,(ENTFA,STRP1)),(((BACSU,GEOKA),LISMO),STAA1)));

Изображение:

Дерево содержит нетривиальные ветви:

1) {FINM2,LACDA,ENTFA,STRP1} против {BACSU,GEOKA,LISMO,STAA1}
2) {FINM,BACSU,GEOKA,LISMO,STAA1} против {LACDA,ENTFA,STRP1}
3) {ENTFA,STRP1} против {FINM,LACDA,BACSU,GEOKA,LISMO,STAA1}
4) {BACSU,GEOKA} против {LISMO,STAA1,LACDA,ENTFA,STRP1,FINM2}
5) {BACSU,GEOKA,LISMO} против {STAA1,LACDA,ENTFA,STRP1,FINM2}