1. название белка - 1-DEOXY-D-XYLULOSE 5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE 2. код PDB файла - 1JVS 3. метод определения структуры: РСА, разрешение 2.20 A 4. диаметр цепи А - 62.5 A, 62.5*10-10 м, 31.25*10-4 длины бактерии E.COLI |
Здесь изображены две цепи моего белка, лиганд NDP, с которым белок взаимодействует а также входящие в состав белка сульфат ионы и селенометионин. Маленькими голубенькими шариками обозначены молекулы воды | |
select within (4.5, ndp2001) and *a
echo These are atoms that influence on binding NDP and protein
echo This is SER11 that probably doesn't affect on the possibility of binding NDP and protein
|
Этот скрипт создан для описания моего белка. Здесь показана зона контакта моего белка с лигандом, выделены разными цветами аминокислотные остатки, которые я предлагаю для генно-инженерного эксперимента. Также показаны все атомы, которые взаимодействуют с моим белком. В то же время скрипт генерирует общее изображение белка и его состав,взаимодействующий лиганд |