На первую страницу второго семестра
Консервативные аминокислотные остатки в выборке 10 потенциальных ортологов белка DXR_ECOLI
Матрица попарного сходства(% совпадения) последовательностей Моей выборки
DXR_ECOLI DXR_MANSM DXR_HAEIN DXR_PASMU DXR_HAEDU DXR_YERPE DXR_PHOLL DXR_ERWCT DXR_VIBPA DXR_VIBCH
DXR_ECOLI 100%
DXR_MANSM 61% 100%
DXR_HAEIN 61% 74% 100%
DXR_PASMU 62% 76% 75% 100%
DXR_HAEDU 62% 70% 73% 71% 100%
DXR_YERPE 71% 60% 60% 62% 63% 100%
DXR_PHOLL 69% 58% 59% 61% 59% 72% 100%
DXR_ERWCT 72% 60% 61% 62% 61% 74% 69% 100%
DXR_VIBPA 59% 55% 57% 59% 58% 56% 55% 59% 100%
DXR_VIBCH 59% 53% 56% 57% 57% 56% 57% 59% 72% 100%
Множественное выравнивание, на котором цветом выделены консервативные позиции
Красным выделены аминокислотные остатки, которые консервативны на 100%,а синим- на 80%
Изображение 3D-структуры белка DXR_ECOLI с отмеченными консервативными остатками
Здесь зеленым цветом выделены аминокислоты консервативные на 100%, а синим- на 80%
Из моей картины видно, что зона контакта белка DXR_ECOLI с лигандом высоко консервативна. Это нужно для того, чтобы при очень частой замене на неродственные
аминокислоты в таких участках может произойти потеря способности связывания белка с лигандом, а значит и потеря самой функции белка.