Изображение дерева

Расстояния даны как число мутаций на 100 нуклеотидных остатков. Длина гена DXR_ECOLI — 1197 нуклеотидных остатков

Полный текст скрипта, который генерирует мутантные последовательности

msbar dxr_gen.fasta dxr_F  -point 4 -count 1197  -auto
msbar dxr_gen.fasta dxr_2  -point 4 -count 479 -auto
msbar dxr_2 dxr_3  -point 4 -count 274 -auto
msbar dxr_2 dxr_4  -point 4 -count 120 -auto
msbar dxr_3 dxr_A  -point 4 -count 323 -auto
msbar dxr_3 dxr_B  -point 4 -count 323 -auto
msbar dxr_4 dxr_E  -point 4 -count 599 -auto
msbar dxr_4 dxr_5  -point 4 -count 395 -auto
msbar dxr_5 dxr_C  -point 4 -count 203 -auto
msbar dxr_5 dxr_D  -point 4 -count 203 -auto

Параметром "-count" является число мутаций пересчитанных не на 100 нуклеотидных остатков, а в расчете на полную последовательность вашего гена.

Параметр "-point" означает тип точечных мутаций, которые должны быть выполнены, а "-point 4" означает, что тип данных мутаций — замена.

Параметр "-auto" позволяет закрывать подсказки