На первую страницу второго семестра

Описание доменной структуры DXR_ECOLI


PPF02670 DXP_reductoisom "1-дезокси-D-ксилулоза-5-фосфат редуктаза-изомераза" 4-132
PB000468 Pfam-B_468 133-290
PB001221 Pfam-B_1221 309-398
N-концевой домен DXR_ECOLI обозначен слева зеленым прямоугольником

Идентификатор PDB- 1jvs.pdb

Описание семейства доменов,к которому относится N-концевой домен DXR_ECOLI (рассматриваются домены только из PfamA)

1-дезокси-D-ксилулоза-5-фосфат редуксизомераза синтезирует 2-C-метил-D-эритритол 4-фосфат из 1-дезокси-D-ксилулоза 5-фосфат в одну стадию путем внутримолекулярной переорганизации и восстановления, и она ответственна за биосинтез терпеноидов в некоторых организмах PUBMED:9707569. В Arabidopsis thaliana 1-дезокси-D-ксилулоза-5-фосфат редуксизомераза - первый описанный фермент из немевалонатного пути для биосинтеза изопреноидов.
Таксон Количество белков с доменом PF00072
Эукариоты Растения 19
Грибы 0
Животные 0
Бактерии 115
Археи 0

Известно 164 белка с DXP_reductoisom типом доменной архитектуры. Основной тип доменной архитектуры единственный и представлен на примере DXR_RHOBA( [ rhodopirellula baltica] 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase). Домен такого типа- единственный домен в белке, он не встречается в белках в сочетании с другими белками, случаи его дупликации тоже неизвестны. Во всех белках он представлен одинаково.