| Код |
EC 3.5.1.38 |
EC 3.5.1.1 |
| Расшифровка кода |
EC 3 - гидролазы
EC 3.5 - воздействующие на углерод-азотные связи,отличающиеся от пептидных
EC 3.5.1- в линейных амидах.
|
EC 3 - гидролазы
EC 3.5 - воздействующие на углерод-азотные связи,отличающиеся от пептидных
EC 3.5.1- в линейных амидах
|
| Название |
Глутаминаза |
аспарагиназа;
аспарагиназа II;
L-аспарагиназа;
коласпаза;
|
| Субстрат |
L- глутамин; Н2О |
L-аспарагин,
H2O
|
| Продукт |
L- глутамат; NH3 |
L-аспартат, NH3 |
| Катализируемая реакция |
L- глутамин + Н2О = L- глутамат + NH3 |
L-аспарагин + H2O = L-аспартат + NH3
|
| Участие в метаболических путях |
Glutamate metabolism;
Alanine and aspartate metabolism;
D-Glutamine and D-glutamate metabolism;
Nitrogen metabolism
|
Alanine and aspartate metabolism;
Cyanoamino acid metabolism;
Nitrogen metabolism
|
| Общее число генов |
5 |
216 |
| Мотивы |
PS: PS00144 [LIVM]-x(2)-T-G-G-T-[IV]-[AGS]
PS: PS00917 [GA]-x-[LIVM]-x(2)-H-G-T-D-T-[LIVM]
|
PS: PS00144 [LIVM]-x(2)-T-G-G-T-[IV]-[AGS]
PS: PS00917 [GA]-x-[LIVM]-x(2)-H-G-T-D-T-[LIVM]
|
| PDB ID структур |
1DJO 1DJP 4PGA |
1AGX 1HFJ 1HFK 1HFW
1HG0 1HG1 1HO3 1IHD
1JAZ 1JJA 1JN9 1JSL
1JSR 1K2X 1NNS 1O7J
1T3M 1WLS 1WNF 1WSA
3ECA 3PGA 4ECA
|
- Мое задание:
Сравнить пути в разных организмах и высказать предположение о биологическом смысле наблюдаемого, например, о последствиях для жизни каждого из организмов.
Биосинтез треонина из гомосерина (homoserine) у E.coli K-12 MG1655 и облигатного внутриклеточного симбионта Buchnera aphidicola APS.
- Название пути, идентификаторы использованных карт.
Идентификаторы использованных карт: общая карта- ; карта биосинтеза у E.coli K-12 MG1655- ; карта биосинтеза у Buchnera aphidicola APS-00260;
- Изображение фрагмента карты(reference map), соответствующего заданию
- 4. Количество реакций во фрагменте, соответствующкм заданию. Укажите, откуда берется первое вещество, во что может превратиться последнее.
В обоих случаях колическтво реакций одинаково: первое вещество- гомосерин получается одним способом- из L-Aspartate 4-semialdehyde, а последнее вещество- Треонин- может превратиться в 2-Oxobutanoate, L-Threonyl-tRNA(Thr), Glycine, L-2-Amino-acetate.
- Сравнение путей у заданных организмов (желательно с картинками из KEGG).
Внимательно просмотрев пути биосинтеза у обоих организмов, я придла к выводу,что они полностью одинаковы. И у E.coli, и у Buchnera aphidicola биосинтез треонина из гомосерина проходит при образовании промежуточного вещества- O-фосфо-L-гомосерина. Реакция,в ходе которой из гомосерина образуется O-фосфо-L-гомосерин, катализируется ферментом гомосерин киназой (homoserine kinase), код которого 2.7.1.39, а реакция образования треонина из O-фосфо-L-гомосерина катализируется ферментом треонин синтазой (threonine synthase), код которого 4.2.3.1
- Ваши предположения о биологическом смысле наблюдаемого, о том, какие последствия это имеет для жизни сравниваемых организмов.
Так как данный биосинтез ничем не отличается у обоих организмов,то можно сделать вывод, что данный метаболизм является основополагающим. В том и другом организмах синтез этой аминокислоты (треонина) не является заменимым и субстратом является уникальный гомосерин,который также нельзя ничем заменить!
