Бета-тяжи номер 7 и 8

Бета-тяжи номер 7 и 8
Пара соседних бета-тяжей strand7 199-203:A и strand8 214-218:A.
Изображение цепи в остовном виде с бета-тяжами в ленточной модели
Углы
Значения торсионных углов в пределах тяжей: Среднее значение Phi: -130,55 Max Phi: -83,90 Min Phi: -166,90 Среднее значение Psi: 107,73 Max Psi: 170,20 Max Psi: -171,90	Карта Рамачандрана для остатков бета-тяжей:

Изображение паттерна водородных связей между остовными атомами тяжей
Изображение тяжей в шарнирной модели с раскраской по атомам и водородными связями
Водородные связи между остовными атомами тяжей
RasMol обнаруживает водородные связи между следующими атомами: TYR217A.O MET200A.N TYR217A.N MET200A.O ALA215A.O PHE202A.N ALA215A.N PHE202A.O Водородная связь наблюдается между атомами кислорода и азота Пара бета-тяжей имеет всего 4 водородных связи, поэтому тут закономерности не так хорошо прослеживаются. В целом видно, что в 1 молекуле атомы O и N образуют водородные связи с атомами N и O соответственно другой молекулы. Номера молекул, между атомами которых образуются связи, не упорядочены, но, очевидно, идут в противоположном порядке. Это происходит из-за того, что связанные части (стрэнды) белка идут антипараллельно.
Контакты тяжей с остальной частью молекулы
Изображение тяжей в остовной модели и контактирующих атомов	Видно, что контакты тяжей с остальной частью молекулы не очень равномерно распределены в пространстве.
Таблица.Контакты бета-тяжей 199-203 и 214-218 с остальной частью цепи А белка из записи PDB 1P3W. Имя атома остатка спирали Имя контактирующего атома Расстояние в A Предположительная природа контакта LEU216A.N VAL70A.O 2.73 Водородная связь? GLY214A.O THR72A.N 2.89 Водородная связь? VAL218A.CB MET239A.SD 4.26 Гидрофобное взаимодействие? MET200A.SD LEU192A.CD2 4.18 Гидрофобное взаимодействие?

Главная страница
К работам первого семестра