Биологический смысл выравнивания

Наложение пространственных структур выданных последовательностей.Выполнено в программе RasMol.



Выравнивание "вручную" с помощью программы GeneDoc





Выравнивание с помощью программы needle

ссылка на файл в формате msf, сохранённый из GeneDoc

Выравнивания,построенные с помощью программы GeneDoc и Needle коренным образом отличаются.

Выравнивание,построенное с помощью программы Needle содержит огромное количество гэпов,

в то время как в выравнивании,построенном "вручную" они практически отсутствуют.

Это свидетельствует о том,что биологический смысл имеет выравнивание,основанное на пространственном наложении структур.

Но стоит отметить,что математическое выравнивание имеет больший вес.


©Терешкова Алеся,2009e