Шестой семестр.
Молекулярное моделирование биополимеров.
1.Введение в PYMOL.
2.Cеми-эмпирические вычисления: Mopac.
3.Abinitio вычисления для нафталина и азулена.
4.Вычисление параметров для молекулярной механики.
5.Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики.
6.Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS.
7.Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS.
8.Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом .
9.Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка.