Рис. 1. Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе таксономии.
Представители VIVIN, PANTI, HYABR относятся к подотряду Feliformia (Кошкообразные),
а остальные — к отряду Caniformia (Собакообразные). URSAR и MELUS —
представители семейства Ursidae (Медвежьи). CANLU, CANAU и VULLA — представители семейства Canidae (Псовые). Это два волка и лиса.
Отсутствие дихотомичности дерева на уровне подотрядов была неизбежна, так как в отряде Хищные выделяется всего два подотряда.
В отличие от других деревьев длина ветвей у данного дерева ничего не означает.
Рис. 2. Филогенетическое дерево представителей Carnivora,
филогенетическая реконструкция проведена программой fastme с
p-distance в качестве эволюционной модели. Для укоренения в качестве аутгруппы была
взята клада из трех представителей подотряда Кошкообразные
(все представители отряда делятся на подотряд Кошкообразнын и подотряд Собакообразные).
Цветом выделены клады, которые можно
назвать верно реконструированными относительно таксономии. Об остальном трудно судить,
так как из-за недихотомичности дерева, построенного по таксономии, образованные клады
не с чем сравнивать. Зато можно отметить, что реконструкция по последовательностям
цитохрома B дает больше информации и позволяет лучше проследить филогению группы чем
сравнение таксономии отдально взятых животных.
Рис. 3. Филогенетическое дерево представителей Carnivora,
филогенетическая реконструкция проведена программой fastme с
MtREV в качестве эволюционной модели. Для укоренения в качестве аутгруппы была
взята клада из трех представителей подотряда Кошкообразные.
Цветом выделены клады, которые можно
назвать верно реконструированными относительно таксономии.
Клады полностью аналогично таковым на дереве на Рис. 2.
Однако надо заметить, что длины некоторых ветвей отличаются от таковых на предыдущем дереве.
Это результат использования другой модели для оценки эволюционных расстояний.
Рис. 4. Филогенетическое дерево представителей Carnivora,
филогенетическая реконструкция проведена программой iqtree с параметрами
по-умолчанию. Для укоренения в качестве аутгруппы была
взята клада из трех представителей подотряда Кошкообразные.
Розовым и жёлтым цветом выделены клады, которые можно
назвать верно реконструированными относительно таксономии.
Зеленая клада реконструирована не совсем верно. Она должна существовать,
но судя по таксономии два волка (мнемоники CANLU и CANAU) должны быть объединены в кладу
раньше чем один из волков с лисой (мнемоники CANAU и VULLA), как получилось на этом дереве.