Рис. 1. Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе
последовательностей 12S рРНК.
Дерево аналогично дереву, построеннному по таксономии.
Однако интересно, что в отличие от деревьев по цитохрому B,
PANTI объединен в кладу с HYABR, а не с VIVIN.
Помимимо этого группы видов иначе расположены друг
относительно друга: например, все виды, обозначенные черным цветом,
объединились в одну кладу, а не разнесены на дереве.
Рис. 2. Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе таксономии.
Представители VIVIN, PANTI, HYABR относятся к подотряду Feliformia (Кошкообразные),
а остальные — к отряду Caniformia (Собакообразные). URSAR и MELUS —
представители семейства Ursidae (Медвежьи). CANLU, CANAU и VULLA — представители семейства Canidae (Псовые).
Это два волка (серый волк и шакал) и лиса.
Отсутствие дихотомичности дерева на уровне подотрядов была неизбежна, так как в отряде Хищные выделяется всего два подотряда.
В отличие от других деревьев длина ветвей у данного дерева ничего не означает.
Рис. 1. (Ещё раз, для удобства сравнения)
Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе
последовательностей 12S рРНК.
Дерево аналогично дереву, построеннному по таксономии.
Однако интересно, что в отличие от деревьев по цитохрому B,
PANTI объединен в кладу с HYABR, а не с VIVIN.
Помимимо этого группы видов иначе расположены друг
относительно друга: например, все виды, обозначенные черным цветом,
объединились в одну кладу, а не разнесены на дереве.
Рис. 3. Филогенетическое дерево представителей Carnivora,
филогенетическая реконструкция проведена программой fastme с
p-distance в качестве эволюционной модели.
Рис. 4. Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе
последовательностей 12S рРНК. Применено укоренение во внешнюю группу.
В качестве таковой взята антилопа Sylvicapra grimmia (мнемоника SYLGR)
- на дереве отмечена синим цветом. Это подходящая аутгруппа, так как
она не относится к отряду Carnivora, однако относится к надотряду Laurasiatheria,
как и все остальные организмы на дереве, то есть это не слишком далекая группа.
В сравнении с деревом без аутгруппы расположение и состав клад не изменились.
Однако поменялись длины ветвей разных групп друг относительно друга.
Рис. 5. Филогенетическое дерево представителей Carnivora на основе
последовательностей 12S рРНК. Применено укоренение во внешнюю группу
и бутстреп (100 реплик). Можно заметить, что те клады, которые существуют не на всех
деревьях (например, между которыми есть различия на дереве по 12S и по цитохрому B),
имеют более низкую поддержку чем клады, которые существуют на всех деревьях, включая
построенное по таксономии. Например, клады PANTI + HYABR (80) и
жёлтые + черные (выделенные таким цветом на деревьях) (50) в
отличие от клады MELUS + URSAR (100). Таким образом
на моём дереве можно проследить закономерность "верно реконструировано - высокий бутстреп",
но только моих данных мало чтобы быть полностью уверенным.