Состав записи 1ah5 из банка PDB

                  
HEADER    LYASE                                   13-APR-97   1AH5              
TITLE     REDUCED FORM SELENOMETHIONINE-LABELLED HYDROXYMETHYLBILANE            
TITLE    2 SYNTHASE DETERMINED BY MAD                                           
Поле HEADER содержит заголовок структуры, поле TITLE содержит название структуры, поле COMPND содержит информацию о цепях макромолекул
COMPND    PURINE NUCLEOTIDE SYNTHESIS REPRESSOR/DNA COMPLEX- описание белка RNH_ECOLI
COMPND    MOL_ID: 1;                                                            
COMPND   2 MOLECULE: HYDROXYMETHYLBILANE SYNTHASE;                              
COMPND   3 CHAIN: NULL;                                                         
COMPND   4 FRAGMENT: THREE DOMAINS;                                             
COMPND   5 SYNONYM: PORPHOBILINOGEN DEAMINASE;                                  
COMPND   6 EC: 4.3.1.8;                                                         
COMPND   7 ENGINEERED: YES;                                                     
COMPND   8 BIOLOGICAL_UNIT: MONOMER;                                            
COMPND   9 OTHER_DETAILS: CONTAINS A DIPYRROMETHANE COFACTOR LINKED TO          
COMPND  10 THE RESIDUE CYSTEINE 242                                             
  - описание белка в PDB
В PDB используется трёхбуквенное написание аминокислотных остатков, а не однобуквенное, как в файле, откуда мы копировали структуру белка
В PDB файле последовательность аминокослот записана в 25 строк по 13 аминокислот в каждой.
Каждая строка пронумерована и после номера пишется общее количество аминокислот.
В описании белка HEM3_ECOLI поледовательность записана в виде столбиков, в строках которых находится по 10 аминокислот,
количество аминокислотных остатков вынесено в самом начале после SEQUENCE :

SQ   SEQUENCE   313 AA;  33852 MW;  7276981B52C7D1E3 CRC64;
     MLDNVLRIAT RQSPLALWQA HYVKDKLMAS HPGLVVELVP MVTRGDVILD TPLAKVGGKG
     LFVKELEVAL LENRADIAVH SMKDVPVEFP QGLGLVTICE REDPRDAFVS NNYDSLDALP
     AGSIVGTSSL RRQCQLAERR PDLIIRSLRG NVGTRLSKLD NGEYDAIILA VAGLKRLGLE
     SRIRAALPPE ISLPAVGQGA VGIECRLDDS RTRELLAALN HHETALRVTA ERAMNTRLEG
     GCQVPIGSYA ELIDGEIWLR ALVGAPDGSQ IIRGERRGAP QDAEQMGISL AEELLNNGAR
     EILAEVYNGD APA
//
Последовательность в PDB файле не отличается от последовательности в белка HEM3_ECOLI. 
Из полей HET, HETNAM и FORMUL получили следующую информацию:
1)в белке есть 1 лиганд DPM имеющий формулу C20H24N2O8, номер в цепи 314 и полное название DIPYROMETHANE COFACTOR
2)в белке есть 5 лигандов MSE имеющий формулу C5H11N1O2SE1, номер в цепи 28,41,82,234,286 и полное название SELENOMETHIONINE 
3)в белке есть 177 лигандов воды имеющий формулу HOH

  Компоненты структуры, описанной в документе  PDB 1ah5  
Заголовок структуры: LYASE
Название структуры: Reduced form selenmethionine- labelled hydroxymethylbilane synthase determined by mad
В документе представлены следующие цепи макромолекул: Hydroxymethylbilane synthase (E.C.4.3.1.8)

В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества:

ID	Название	Формула	Число копий	Комментарии
MSE	Селенометионин	C5H11N1O2Se1	5
DPM	Dipyromethane cofactor	C20H24N2O8	1
HOH	Вода	H2O	177

Изображение альфа-спиралей(красные) и бета-тяжей(зеленые)	Остовная модель белка (1 цепь)