Задание 1.
• Ссылка на файл с результатом • JalView-проект
 1. |
 2. |
 3. |
1. На обратной последовательности уровень шума соизмерим с высотой скачка аденина, так что программа поставила N; в хроматограмме прямой последовательности очевидно, что в 13 позиции находится аденин.
2. На прямой последовательности наблюдается полиморфизм. Программа однозначно выставила тимины.
3. В то время как для обратной последовательности хроматограмма начинает становится нечитаемой, сравнив ее с прямой пследовательностью можно предположить, какие из пиков являются шумом.
Характеристика хроматограммы в целом:
1)Нечитаемые участки: в прямой последовательности первые 137 нуклеотидов 5' конца, первые 98 нуклеотидов 3' конца. в обратной последовательности первые 73 нуклеотидов 3' конца, первые 161 нуклеотидов 3' конца.
2)На читаемых участках хроматограммы шум в среднем составляет 10-15% сигнала. Шум усиливается в начале и конце хроматограммы.
Задание 2
Здесь представлен нечитаемый кусок хроматограммы прямой последовательности, использованной в задании 1. Из-за высокого уровня шума невозможно различить отдельные пики, также есть слишком широкие и высокие пики, многократно повторяющиеся пики(сигнал аденина в конце хроматограммы).