Аденоассоциированные вирусы (ЛАВ) - это небольшие непатогенные вирусы человека с одноцепочечным ДНК-геномом длиной около 4,7 тысяч нуклеотидов, который может интегрировать в специфический сайт 19-й хромосомы.Размер вирусов составляют около 20 нм, они не имеют липидной оболочки и не кодируют собственных ферментов репликации.Такое название они получили потому, что для продуктивной инфекции им необходимы белки другого вируса (вируса-помощника), например аденовируса. После того как ААВ попадает в ядро,его геном с помощью полимераз клетки-хозяина преобразуется в двухцепочечную ДНК и транскрибируется.
в таблице 1 приведены основные параметры генома вируса
Таблица 1
| Параметр | Значение |
| Латинское название вируса | Adeno-associated virus-8 |
| Русское название вируса | Аденоассоциированный вирус |
| Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
| Общая длина генома (п.н.) | 4393 |
| Количество кодируемых в геноме полипептидов | 2 |
Самая короткая последовательность белка в геноме:
|
>YP_077179.1 nonstructural protein MPGFYEIVIKVPSDLDEHLPGISDSFVNWVAEKEWELPPDSDMD RNLIEQAPLTVAEKLQRDFLVQWRRVSKAPEALFFVQFEKGESYFHLHVLVETTGVKS MVLGRFLSQIREKLGPDHLPAGSSPTLPNWFAVTKDAVMAPAGGNKVVDECYIPNYLL PKTQPELQWAWTNMEEYISACLNLAERKRLVAQHLTHVSQTQEQNKENLNPNSDAPVI RSKTSARYMELVGWLVDRGITSEKQWIQEDQASYISFNAASNSRSQIKAALDNAGKIM ALTKSAPDYLVGPSLPADITQNRIYRILALNGYDPAYAGSVFLGWAQKKFGKRNTIWL FGPATTGKTNIAEAIAHAVPFYGCVNWTNENFPFNDCVDKMVIWWEEGKMTAKVVESA KAILGGSKVRVDQKCKSSAQIDPTPVIVTSNTNMCAVIDGNSTTFEHQQPLQDRMFKF ELTRRLEHDFGKVTKQEVKEFFRWASDHVTEVAHEFYVRKGGASKRPAPDDADKSEPK RACPSVADPSTSDAEGAPVDFADRYQNKCSRHAGMLQMLFPCKTCERMNQNFNICFTH GVRDCSECFPGVSESQPVVRKRTYRKLCAIHHLLGRAPEIACSACDLVNVDLDDCVSE Q |
Источники:
http://dic.academic.ru/
Молекулярная биотехнология - Глик Б., Пастернак Дж.