Алгоритмы BLAST

На сайте NCBI я сделала запрос в "сборном" банке "Nucleotides": ("chromosome"[Title]) AND "Treponema"[Organism] , где мне выдало 189 резульатов.

Мною были выбрали представители одного рода Treponema: Treponema pallidum strain UW15993L chromosome NZ_CP124556.3,Treponema pallidum strain P-21-20120 chromosome NZ_CP124573.3. Ниже представлены результаты MegaBlast и BLASTN.

MegaBlast
Рис.1. MegaBlast.
BLASTN
Рис.2. BLASTN.

При сравнении резульатов обоих алгоритмов видно что Blastn выявил гораздно больше участков сходства чем MegaBlast (видим шум, локальные участки сходства). Но в целом резульаты очень похожи, что и понятно, так как организмы близкородственные, поэтому делеций, инсерций, мутаций не обнаружено. В области 150к выделяется столбик в обоих алгоритмах, что свидельствует что и MegaBlast и Blastn нашли регионы потворов.