Филогенетические деревья
Бактерии
| Название | Мнемоника |
|---|---|
| Aromatoleum aromaticum | AROAE |
| Brucella suis | BRUSU |
| Escherichia coli | ECOLI |
| Polynucleobacter asymbioticus | POLAQ |
| Rhizobium meliloti | RHIME |
| Shewanella denitrificans | SHEDO |
| Thiobacillus denitrificans | THIDA |
Дерево
C помощью скобочной формулы ((BRUSU,RHIME),(((SHEDO,ECOLI),POLAQ),(THIDA,AROAE))) было получено дерево с сайта iTOL
Ветви дерева
Здесь содержится 4 нетривиальные ветви:
- {RHIME, BRUSU} против {ECOLI, SHEDO, AROAE, THIDA, POLAQ}
- {AROAE, THIDA} против {POLAQ, ECOLI, SHEDO, BRUSU, RHIME}
- {ECOLI, SHEDO} против {AROAE, THIDA, POLAQ, BRUSU, RHIME}
- {AROAE, THIDA, POLAQ} против {ECOLI, SHEDO, BRUSU, RHIME}
Реконструкция филогении.
Отобранные бактерии относятся к следующим таксонам:
- Aromatoleum aromaticum(AROAE) – Betaproteobacteria; Rhodocyclales
- Thiobacillus denitrificans(THIDA) – Betaproteobacteria; Nitrosomonadales
- Escherichia coli(ECOLI) – Gammaproteobacteria; Enterobacterales
- Shewanella denitrificans(SHEDO) – Gammaproteobacteria; Alteromonadales
- Brucella suis(BRUSU) – Alphaproteobacteria; Rhizobiales
- Rhizobium meliloti(RHIME) – Alphaproteobacteria; Rhizobiales
- Polynucleobacter asymbioticus(POLAQ) – Betaproteobacteria; Burkholderiales