Краткое описание генома вируса Dobrava-Belgrade virus

Вирус Добрава-Белград (Dobrava-Belgrade virus) — вирус рода Hantavirus семейства Bunyaviridae. Этот вирус имеет оболочку, а его геном представлен одноцепочечной РНК отрицательной полярности (то есть белок синтезируется не с самой геномной РНК, а с комплементарной ей цепи). У человека этот вирус вызывает геморрагическую лихорадку с почечным синдромом. Летальность этого заболевания достигает 12 %, что делает его одним из наиболее опасных заболеваний, вызываемых вирусами рода Hantavirus, в Европе. Первоначально вирус был описан у желтогорлой мыши (Apodemus flavicollis), найденной в деревне Добрава, Словения, Югославия, однако в настоящее время он известен и вне Балкан. Эволюция и генетическое разнообразие этого вируса ещё слабо изучены [1] [2] .

Рис 1. Желтогорлая мышь (Apodemus flavicollis) - животное, у которого впервые был описан вирус Добрава-Белград

В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вирус Добрава-Белград [3]

.
Таблица 1. Основные параметры генома вируса Dobrava-Belgrade virus
Латинское название вирусаDobrava-Belgrade virus
Русское название вирусаВирус Добрава-Белград
Количество фрагментов в полном геноме3
Общая длина генома (п.н.)11840
Количество кодируемых в геноме белков3

Аминокислотная последовательность нуклеокапсидного белка вируса Dobrava-Belgrade virus (NP_942553.1) [4] 
>gi|38505523|ref|NP_942553.1| nucleocapsid protein 
MATLEELQKEINNHEGQLVIARQKVKDAEKQYEKDPDDLNKRALSDRESIAQSIQGKIDE
LRRQLADRVAAGKNIGKERDPTGLDPGDHLKEKSMLSYGNVIDLNHLDIDEPTGQTADWL
SIVVYLTSFVVPILLKALYMLTTRGRQTTKDNKGMRIRFKDDSSFEDVNGIRKPKHLFLS
MPNAQSSMKADEITPGRFRTAICGLYPAQVKARNLISPVMSVIGFLALAKNWTERVEEWL
DLPCKLLSEPSPTSLTKGPSTNRDYLNQRQGALAKMETKEAQAVRKHAIDAGCNLIDHID
SPSSIWVFAGAPDRCPPTCLFIAGMAELGAFFAVLQDMRNTIMASKTIGTSEEKLKKKSS
FYQSYLRRTQSMGIQLDQRIIVLFMVDWGKEAVDSFHLGDDMDPELRGLAQALIDQKVKE
ISNQEPLKL

Источники:

[1] Papa A., Dobrava-Belgrade virus: Phylogeny, epidemiology, disease, Antiviral Research 95(2):104–117, 2012.

[2] Dobrava-Belgrade virus: page in English Wikipedia

[3] Dobrava-Belgrade virus RefSeq Genome

[4] Dobrava virus complete S segment gene for nucleocapsid protein, strain DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999. NCBI Reference Sequence: NC_005233.1

Вернуться на страницу первого семестра

© Елизавета Минина 2015