Визуализация молекул в JMol

**Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре**
#	Имена атомов	Длина связи (Å)	Угол N-O-C (°)
Альфа-спирали
1	N(237GLN)-O(233ASN)	3,24	148,5
2	N(234ALA)-O(223PHE)	3,11	143,3
3	N(225GLY)-O(221LYS)	2,83	164,7
Бета-тяжи
1	N(736GLU)-O(311CYS)	2,94	109,6
2	N(313GLN)-O(734VAL)	2,96	152,2
3	N(734VAL)-O(313GLN)	2,77	110,1

Измерения водородных связей в бета-тяжах показали, что типичная длина связей в этих структурах составляет чуть меньше трёх ангстрем, а угол N-O-C тупой (более 100 градусов). В альфа-спиралях длина водородных связей также близка к 3 Å, и угол N-O-C также имеет значение, большее 100°.