1. Основная информация о белке Q21MB1_SACD2

Uniprot IDQ21MB1_SACD2
Uniprot ACQ21MB1
Refseq IDWP_011467389.1; NC_007912.1
PDB ID4ZLE, 4ZLF, 4ZLG, 4ZLI
Длина (в аминокислотных остатках)788
Молекулярная масса, Да88701
Рекомендуемое Uniprot названиеPutative b-glycan phosphorylase (предполагаемая фосфорилаза b-гликана)
Белок представлен единственной цепью (А), и во всех структурах PDB визуализированы все её 788 аминокислотных остатков.

2. Кластеры

КластерОписание кластераИдентификатор кластераКоличество белков в кластере
UniRef100Включает идентичные последовательности и фрагменты длиной более 11 остатковUniRef100_Q21MB11
UniRef90Включает последовательности из UniRef100, которые имеют по крайней мере 90 % идентичности и 80 % перекрывания с самой длинной последовательностью в кластереUniRef90_Q21MB11
UniRef50Включает самые длинные последовательности из UniRef50, которые имеют по крайней мере 50 % идентичности и 80 % перекрывания с самой длинной последовательностью в кластереUniRef50_Q8P3J4304

3. Поиск в UniProt

Цель поискаПоисковый запросКоличество найденных белковКоличество найденных белков из раздела Reviewed
Поиск по рекомендованному названиюname:putative name:"b glycan" name:phosphorylase10
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семействаname:putative name:"b glycan" name:phosphorylase taxonomy:"Cellvibrionaceae [1706371]"10
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же отделаputative "b glycan" phosphorylase taxonomy:"Proteobacteria [1224]"10
Поиск по названию цитохром (cytochrome) без ограничения на организмыname:cytochrome11762897464
Поиск по названию цитохром (cytochrome) среди членистоногих (Arthropoda)name:cytochrome taxonomy:"Arthropoda [6656]"518878230
Поиск по названию цитохром (cytochrome) среди инфузорий (Ciliophora)name:cytochrome taxonomy:"Ciliophora [5878]"12486
Поиск по названию "трипсин" (trypsin)name:trypsin11008301
Поиск по названию "трипсин" (trypsin), исключающий ингибиторы трипсинаname:trypsin NOT name:inhibitor865398
Таким образом, на запрос "trypsin" было выдано, помимо прочего, 11008 - 8653 = 2355 ингибитора трипсина.

4. Записи RefSeq

Первая запись в RefSeq WP_011467389.1 содержит последовательность белка, однако гораздо меньше информации о белке, чем запись в UniProt: нет молекулярной массы, сведений о структуре, не приведены идентификаторы PDB, не указана первичная публикация о белке, однако есть информация об отдельных функциональных участках. Вторая запись в RefSeq NC_007912.1 соответствует бактерии Saccharophagus degradans, у которой был описан этот белок.

5. История изменений записи UniProt Q21MB1_SACD2

Список предыдущих версий страницы. Первая последовательность была загружена 18 апреля 2006 года, а последняя версия последовательности была загружена 16 марта 2016.

6. Необычные свойства белков в UniProt

На примере TRY1_HUMAN (человеческий трипсин-1).

* В разделе Pathology & Biotech содержится информация об аминокислотных заменах, происходящих при определённых заболеваниях.

* Информация о дисульфидных связях и посттрансляционных модификациях находится в разделе PTM / Processing в подразделе Amino acid modifications. В случае трипсина имеет место необычная модификация - сульфатирование остатка Tyr-154.


© Елизавета Минина 2015