В данном практикуме требовалось выбрать 7-8 бактерий из списка и построить филогенетическое дерево выбранных видов на основе дерева всех видов выборки.
В таблице ниже приведён список выбранных бактерий и мнемоник этих видов, которые указаны в дереве.
| № | Название вида | Мнемоника | Таксономия |
| 1 | Pseudomonas aeruginosa | PSEAE | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas |
| 2 | Enterobacter sp. 638 | ENT38 | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Enterobacter |
| 3 | Escherichia coli | ECOLI | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Escherichia |
| 4 | Yersinia pestis | YERPE | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Yersinia |
| 5 | Yersinia pseudotuberculosis | YERPS | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Yersinia |
| 6 | Haemophilus influenzae | HAEIN | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Haemophilus |
| 7 | Pasteurella multocida | PASMU | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Pasteurella |
| 8 | Salmonella typhimurium | SALTY | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Salmonella; Salmonella enterica; Salmonella enterica subsp. enterica |
Скобочная формула дерева выглядит следующим образом:
(PSEAE, (((ENT38, (SALTY, ECOLI)), (YERPS, YERPE)), (PASMU, HAEIN)));
А вот так выглядит дерево выбранных бактерий:
Представленное выше дерево содержит пять нетривиальных ветвей:
1) {SALTY, ECOLI} против {PSEAE, ENT38, YERPS, YERPE, PASMU, HAEIN}
2) {ENT38, SALTY, ECOLI} против {PSEAE, YERPS, YERPE, PASMU, HAEIN}
3) {ENT38, SALTY, ECOLI, YERPS, YERPE} против {PSEAE, PASMU, HAEIN}
4) {YERPS, YERPE} против {PSEAE, ENT38, SALTY, ECOLI, PASMU, HAEIN}
5) {PASMU, HAEIN} против {PSEAE, ENT38, SALTY, ECOLI, YERPS, YERPE}
В таксономическом отношении все исследуемые бактерии относятся к гамма-протеобактериям. Удалось найти соответствие между следующими нетривиальными ветвями и таксонами (нумерация ветвей как в предыдущем пункте):
* Ветвь 2 выделяет семейство Enterobacteriaceae;
* Ветвь 3 выделяет порядок Enterobacterales;
* Ветвь 4 объединяет организмы рода Yersinia из семейства Yersiniaceae порядка Enterobacterales;
* Ветвь 5 выделяет организмы семейства Pasteurellaceae порядка Pasteurellales.