Метаболичекие пути фермента P37268
Идентификатор фермента сквален-синтазы в KEGG - hsa:2222 ("hsa" означает организм Homo sapiens). Ген фермаента в этой базе данных ассоциирован с путем биосинтеза стероидов (Steroid biosynthesis, hsa00100). С картой этого пути можно ознакомиться здесь или на картинке ниже (рис.1).| Рис. 1. Путь биосинтеза стероидов |
 |
Поиск в KEGG структурных формул заданных соединений
Для выданных соединений были выяснены некоторые их особенности. С главной страницы перейти по "KEGG2" ("KEGG Table of Contents"), а с открывшейся страницы – по гиперссылке "KEGG LIGAND".| Гуанин (Guanine) | Инозин (Inosine) |
| C00242 | C00294 |
 |
 |
Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому
Оба вещества участвуют в метаболизме пуринов (ko00230).Путь, их содиняющий:
Инозин ↔ инозин-5'-монофосфат → ксантозин-5'-фосфат → гуанозинмонофосфат → гуанозин → гуанин Начальное соединение - красным цветом, конечное - зеленым. Промежуточные соединения - желтым. Для просмотра карты в новой вкладке нажмите здесь.
| Рис. 2. Метаболизм пуринов |
 |
Дополнительные возможности KEGG
Сайт приспособлен для поиска белков или генов по последовательностям (BLAST), а также поиска веществ со сходной структурой. Это, наверное, весьма полезная функция при поиске новых лекарств с заданными характеристиками. Сайт может также предсказывать пути синтеза и деградации молекул, основываясь на данных сходным молекул. Кроме того, многие базы внутри KEGG можно отмечать, раскрашивая разными цветами, что облегчает восприятие данных.
© Elizaveta Besedina, FBB 2012
lizaveta@kodomo.fbb.msu.ru