Карты локального сходства

Для задания я выбрала митохондриальные геномы синего кита Balaenoptera musculus (AC: ON675436) и колючей морской звезды Poraniopsis inflata (AC: ON675436).

Геномы я смотрела на сайте NCBI, я использовала запросы (Balaenoptera musculus[Organism]) AND complete и (Poraniopsis inflata[Organism]) AND complete .

На обоих графиках есть одинаковая часть в районе 2700-2800 по горизонтальной оси. Этот участок отвечает за кодирование 16S rRNA, похоже в этом месте произошла инверсия. Больше на Dot Plot megablast ничего нет, что означает, что остальные участки оказались слишком вариабельны для этого алгоритма. Как видно по графику blastn, начиная с 6000 по горизонтальной оси, мы видим более менее полное совпадение. Также в районе 1000 по Ох оси видно соответствие с участком 10500 Poraniopsis inflata, что скорее всего является совпадением последовательностей.