Секвенирование по Сэнгеру:
1) Я работала с файлом 05_F.ab1 для второй группы в программе "Codon Code Aligner".
2) Длина моей хроматограммы составляет 905 оснований.
3) Прямая цепь: начальный трудночитаемый фрагмент - 31 основание, конечный - 183 основания.
Обратная цепь: начальный трудночитаемый фрагмент - 194 основания, конечный - 33 основания.
4) Если исключить начальный и конечный трудночиттаемые фрагменты, то соотношение основных пиков и шума примерно 2 к 1 для обеих цепей.
5) Шума почти нет:
Прямая цепь
Обратная цепь
Шум мешает интерпретации сигнала
Прямая цепь
Обратная цепь
Шум есть, но не мешает интерпретации сигнала
Прямая цепь
Обратная цепь
6) Фотогорафии прямой цепи
171 позиция, есть 2 пика G (с большей вероятностью) и T, оба на уровне шума, поэтому точно сказать нельзя
866 позиция, есть 1 крупный пик T и несколько мелких - C, G, скорей всего было несколько разных образцов ДНК
199 позиция, есть 1 малый пик G, возможно было несколько образцов ДНК, часть которых не удалось прочесть
550 позиция, 2 похожих по высоте (половина основного сигнала) пика - А и Т, должно быть W, было несколько образцов ДНК
326 позиция, 2 пика в половину высоты сигнала - G и Т, должно быть K, скорей всего несколько разных образцов ДНК