Секвенирование по Сэнгеру:

1) Я работала с файлом 05_F.ab1 для второй группы в программе "Codon Code Aligner".

2) Длина моей хроматограммы составляет 905 оснований.

3) Прямая цепь: начальный трудночитаемый фрагмент - 31 основание, конечный - 183 основания. Обратная цепь: начальный трудночитаемый фрагмент - 194 основания, конечный - 33 основания.

4) Если исключить начальный и конечный трудночиттаемые фрагменты, то соотношение основных пиков и шума примерно 2 к 1 для обеих цепей.

5) Шума почти нет:

Nucl1
Прямая цепь
Nucl1
Обратная цепь

Шум мешает интерпретации сигнала

Nucl1
Прямая цепь
Nucl1
Обратная цепь

Шум есть, но не мешает интерпретации сигнала

Nucl1
Прямая цепь
Nucl1
Обратная цепь

6) Фотогорафии прямой цепи

Nucl1
171 позиция, есть 2 пика G (с большей вероятностью) и T, оба на уровне шума, поэтому точно сказать нельзя
Nucl1
866 позиция, есть 1 крупный пик T и несколько мелких - C, G, скорей всего было несколько разных образцов ДНК
Nucl1
199 позиция, есть 1 малый пик G, возможно было несколько образцов ДНК, часть которых не удалось прочесть
Nucl1
550 позиция, 2 похожих по высоте (половина основного сигнала) пика - А и Т, должно быть W, было несколько образцов ДНК
Nucl1
326 позиция, 2 пика в половину высоты сигнала - G и Т, должно быть K, скорей всего несколько разных образцов ДНК