Упражнение 1

Я выбрала Caenorhabditis elegans (Blue whale). Свободноживущая почвенная нематода, около 1 мм размером. Геном состоит из 6 хромосом и 20000 генов. Первый многоклеточный организм, чей геном полностью секвенирован.

Поисковый запрос: Nematoda. В базе была 388 сборок генома, я выбрала сборку WBcel235, уровень сборки - complete (то есть имеется последовательность всех хромосом без каких-лиюо пробелов). Сборка референсная, то есть отобрана вручную и признана эталоном для сравнения с другими данными.

Упражнение 2

N50 - длина , L50 - наименьшее количество контигов, в которых содержится половина всех нуклеотидов сборки

Идентификатор GenBank	Идентификатор RefSeq	Общий размер генома	N50	L50
GCA_000002985.3	GCF_000002985.6	100.3 Mb	17.5 Mb	3

Упражнение 3

Я скачала три файла из RefSec сборки.