Практикум 1
Филогенетическое дерево
Отобранные бактерии
| Название | Мнемоника |
|---|---|
| Yersinia pestis | YERPE |
| Polynucleobacter asymbioticus | POLAQ |
| Serratia proteamaculans | SERP5 |
| Brucella suis | BRUSU |
| Bordetella pertussis | BORPE |
| Agrobacterium fabrum | AGRFC |
| Rhizobium meliloti | RHIME |
| Burkholderia mallei | BURMA |
Скобочная формула дерева
(((POLAQ, BURMA), BORPE), (YERPE, SERP5)) , ((RHIME, AGRFC), BRUSU)))
Ветви дерева
Дерево содержит 5 нетривиальных ветвей:
{BRUSU, AGRFC, RHIME} против {YERPE, SERP5, BORPE, BURMA, POLAQ}
{YERPE, SERP5} против {BRUSU, AGRFC, RHIME, BORPE, BURMA, POLAQ}
{AGRFC, RHIME} против {BRUSU, YERPE, SERP5, BORPE, BURMA, POLAQ}
{BORPE, BURMA, POLAQ} против {BRUSU, AGRFC, RHIME, YERPE, SERP5}
{BURMA, POLAQ} против {BORPE, BRUSU, AGRFC, RHIME, YERPE, SERP5}
Задание 2
На рисунок были добавлены подписи нетривиальных ветвей дерева, ниже приведена таблица полной таксономии
| Название | Таксономия |
|---|---|
| Yersinia pestis | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex |
| Polynucleobacter asymbioticus | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Polynucleobacter |
| Serratia proteamaculans | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Serratia |
| Brucella suis | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Brucellaceae; Brucella/Ochrobactrum group; Brucella |
| Bordetella pertussis | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Bordetella |
| Agrobacterium fabrum | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Agrobacterium; Agrobacterium tumefaciens complex |
| Rhizobium meliloti | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium |
| Burkholderia mallei | Сellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Burkholderia; pseudomallei group |