На главную страницу второго семестра

Описание доменной структуры белка FHUA_ECOLI

В белке имеется 2 домена — N-концевой домен Plug (обозначен зелёным цветом) и C-концевой домен TonB dependent receptor обозначен красным цветом). Также в последовательности есть 4 области низкой сложности и 4 домена из PfamB.

Идентификатор Pfam Сокращённое название Полное название на русском языке Положение домена в последовательности (номера а.о.)
PF07715 Plug Plug домен ТонБ-зависимого рецептора 75–181
PF00593 TonB_dep_Rec ТонБ зависимый рецептор 510–747

На рисунке изображена трёхмерная структура белка FHUA_ECOLI, взятая со страницы базы данных Pfam.

    1) Зелёным изображён домен Plug;
    2) Красным изображён домен TonB dependent receptor.

  β-тяжи, присутствующие в структуре, обозначены стрелками.

  В шарнирной модели показаны лиганд и 8 молекул соединения OES, примыкающих к боковой поверхности белка. Ион железа — в шариковой модели.

  Идентификатор PDB — 1by5.

Описание семейства доменов, к которому относится домен Plug

   Показано, что домен Plug — независимо сворачивающаяся субъединица ТонБ-зависимых рецепторов. Он действует как ворота канала, блокируя отверстие до тех пор, пока канал не свяжет лиганд. Как только это происходит, он подвергается конформационным изменениям и открывает канал.

Встречаемость белков с доменом Plug в различных таксонах

Таксон Количество белков с доменом PF07715
Эукариоты Растения 0
Грибы 0
Животные 1
Бактерии 1412
Археи 0

Анализ основных типов доменной архитектуры белков, содержащих домен Plug

 По данным документа из базы данных Pfam можно установить:

На главную страницу второго семестра

© Лохматиков Алексей,2005