На главную страницу второго семестра

Данные банка Swiss-Prot о белке FHUA_ECOLI

Информация Метка поля Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P06971; P71280; P75665
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID FHUA_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Предшественник рецептора комплекса феррихром-железо (Канал гидроксамат железа) (Рецептор гидроксамат железа)
Дата создания документа DT 01-APR-1988
Дата последнего исправления аннотации DT 01-MAY-2005 (удивительно, но на сайте так и написано!)
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности ID,SQ 747 а.о.
Молекулярная масса белка MW 82182 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 10
Название журнала с самой свежей публикацией RL Protein Sci.
Описание вторичной структуры FT В описании есть 3 столбца, в первом из которых указан элемент вторичной структуры (STRAND, HELIX, TURN), во втором — начальный аминокислотный остаток данного элемента, в третьем — конечный
Содержание поля комментариев CC Темы:
1)Функции белка;
2)Строение субъединицы белка (в данном случае — мономер);
3)Нахождение в клетке;
4)Семейство белков, к которому относится данный белок (tonB-dependent receptor family)
Особенности последовательности FT Перечислены номера остатков сигнального пептида, домены белка и трансмембранные участки, 3 его сайта (TonB box, Ferrichrome binding, TonB C-terminal box), аминокислоты, связанные с лигандом, образующие дисульфидные связи, входящие в элементы вторичной структуры, а также противоречия в данных секвенирования некоторых остатков с данными публикаций
Идентификатор файла PDB DR 1BY3;1BY5;1FCP;1FI1;1QFF;1QFG;1QJQ;1QKC;2FCP

Описание белка в банке данных Swiss-Prot

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка FHUA_ECOLI

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS .

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи (Archaea) (([uniprot-Description:ferrichrome-iron*] & [uniprot-Description:receptor*]) | [uniprot-Description:ferrichrome-iron receptor*]) 0
Бактерии (Bacteria) (([uniprot-Description:ferrichrome-iron*] & [uniprot-Description:receptor*]) | [uniprot-Description:ferrichrome-iron receptor*]) 50
Эукариоты (Eukaryota) (([uniprot-Description:ferrichrome-iron*] & [uniprot-Description:receptor*]) | [uniprot-Description:ferrichrome-iron receptor*]) 0

На главную страницу второго семестра


© Лохматиков Алексей,2005