Go Search

Описание термина Gene Ontology

Термин по-русски	Транспорт иона железа
Термин по-английски	Iron ion transport
Идентификатор GO	0006826
Количество синонимов	1
Определение термина	Направленнное перемещение ионов железа (Fe) внутрь, наружу, внутри или между клетками
Количество родителей	Связь is_a: 1 Связь part_of: 0
Количество дочерних терминов	Связь is_a: 0 Связь part_of: 0

   Связь is_a означает, что родительский термин является более общим термином, чем дочерний, например, cation transport (катионный транспорт) is_a ion transport (ионный транспорт).
   Связь part_of означает, что процесс, характеризуемый дочерним термином, является составной частью процесса, характеризуемого родительским, например, establishment of localization (установление локализации) part_of localization (локализация).
   При связи part_of употребление дочернего термина не означает возможность употребления родительского в полном смысле.

Протеом Homo sapiens. Результаты поиска в UniProt, 4.04.2006 г.

Группа белков протеома	Количество белков	Запрос
Все	70911	(([uniprot-Organism:Homo] & [uniprot-Organism:sapiens]) \| [uniprot-Organism:Homo sapiens*])
С идентификаторами всех 3-х онтологий GO	18261	((([uniprot-Organism:Homo] & [uniprot-Organism:sapiens]) \| [uniprot-Organism:Homo sapiens]) & ((([uniprot-DBxref:C:] & [uniprot-DBxref:F:]) & [uniprot-DBxref:P:]) > parent ))
В том числе в аппарате Гольджи	291	(((([uniprot-Organism:Homo] & [uniprot-Organism:sapiens]) \| [uniprot-Organism:Homo sapiens]) & ((([uniprot-DBxref:C:] & [uniprot-DBxref:F:]) & [uniprot-DBxref:P:]) > parent )) & ([uniprot-DBxref:C:Golgi] > parent ))
В том числе только с самыми хорошими доказательствами функции	39	((((([uniprot-Organism:Homo] & [uniprot-Organism:sapiens]) \| [uniprot-Organism:Homo sapiens]) & ((([uniprot-DBxref:C:] & [uniprot-DBxref:F:]) & [uniprot-DBxref:P:]) > parent )) & ([uniprot-DBxref:C:Golgi] > parent )) & ((([uniprot-DBxref:IDA.] \| [uniprot-DBxref:TAS.]) ! ((((((((([uniprot-DBxref:IMP.] \| [uniprot-DBxref:IGI.]) \| [uniprot-DBxref:IPI.]) \| [uniprot-DBxref:RCA.]) \| [uniprot-DBxref:ISS.]) \| [uniprot-DBxref:IEP.]) \| [uniprot-DBxref:NAS.]) \| [uniprot-DBxref:IEA.]) \| [uniprot-DBxref:IC.]) \| [uniprot-DBxref:ND.])) > parent ))
В том числе только с самыми плохими доказательствами функции	153	((((([uniprot-Organism:Homo] & [uniprot-Organism:sapiens]) \| [uniprot-Organism:Homo sapiens]) & ((([uniprot-DBxref:C:] & [uniprot-DBxref:F:]) & [uniprot-DBxref:P:]) > parent )) & ([uniprot-DBxref:C:Golgi] > parent )) & (((((((([uniprot-DBxref:RCA.] \| [uniprot-DBxref:ISS.]) \| [uniprot-DBxref:IEP.]) \| [uniprot-DBxref:NAS.]) \| [uniprot-DBxref:IEA.]) \| [uniprot-DBxref:IC.]) \| [uniprot-DBxref:ND.]) ! (((([uniprot-DBxref:IMP.] \| [uniprot-DBxref:IGI.]) \| [uniprot-DBxref:IPI.]) \| [uniprot-DBxref:IDA.]) \| [uniprot-DBxref:TAS.])) > parent ))

В качестве хороших доказательств рассматривались обоснования с кодами IDA и TAS, то есть вёлся поиск белков, охарактеризованных только этими терминами GO.
За плохие доказательства были приняты доказательства с кодами RCA, ISS, IEP, NAS, IEA, IC и ND.

Слева можно видеть различные изображения заданного организма — человека.

Описание функции белка FhuA в EcoCyc

   Белок FhuA вовлечён в транспорт феррихрома (своего лиганда) через внешнюю мембрану. Мономер этого белка формирует канал, состоящий из 22 β-тяжей, образующих β-бочонок. FhuA взаимодействует с белком TonB, чтобы перемещать ионы, связанные с лигандом, через внешнюю мембрану клетки. Белок TonB, в свою очередь, вместе с белками ExbB и ExbD также служит для связывания этого процесса с электрохимическим градиентом через внутреннюю мембрану; таким образом, ион-лигандный комплекс накапливается против градиента концентрации, что является процессом активного транспорта.
   В числе других функций белка транспорт албомицина и рифамицина CGP 4832, а также рецепция фагов T5, T1, φ80, UC–1 и пептидов колицина M и микронцина J25.
   Белок FhuA является компонентом системы транспорта феррихрома через внешнюю мембрану.

На главную страницу четвёртого семестра