Метионил-тРНК формилтрансфераза (Methionyl-tRNA formyltransferase)

Краткое название белка - FMT_ECOLI

Полное название организма - Escherichia coli, K– 12.

Название гена - fmt.

Номер локуса в бактериальной хромосоме - b3288.

Последовательность в формате FASTA:

>FMT_ECOLI
MSESLRIIFAGTPDFAARHLDALLSSGHNVVGVFTQPDRPAGRG KKLMPSPVKVLAEEKGLPVFQPVSLRPQENQQLVAELQADVMVVVAYGLILPKAVLEM PRLGCINVHGSLLPRWRGAAPIQRSLWAGDAETGVTIMQMDVGLDTGDMLYKLSCPIT AEDTSGTLYDKLAELGPQGLITTLKQLADGTAKPEVQDETLVTYAEKLSKEEARIDWS LSAAQLERCIRAFNPWPMSWLEIEGQPVKVWKASVIDTATNAAPGTILEANKQGIQVA TGDGILNLLSLQPAGKKAMSAQDLLNSRREWFVPGNRLV

Мои вычисления с помощью EXCEL

Аминокислотный состав белка

Аланин	10,2
Цистеин	1
Аспарагиновая кислота	5,1
Глутаминовая кислота	6
Фенилаланин	1,9
Глицин	7,9
Гистидин	1
Изолейцин	4,8
Лизин	5,1
Лейцин	12,4
Метионин	2,9
Аспарагин	2,9
Пролин	6,7
Глутамин	5,4
Аргинин	4,8
Серин	5,7
Треонин	5,4
Валин	7,6
Триптофан	2,2
Тирозин	1,3

Длина последовательности — 315 а.о.

Молярная масса — 34173 г/моль

Заряд моего белка при pH=7.0 — -3,372.

Скорее всего мой белок не является мембранным: соотношение гидрофобных и гидрофильных аминокислот в нём сильно отличается от такового в мембранных белках.

Аминокислота в FMT_ECOLI в мембранных

Аспарагиновая кислота 5,16 0,40

Глутаминовая кислота 7,5 0,42

Аспарагин 3,97 1,13

Серин 5,85 5,21

Аланин 9,49 12,8

Цистеин 1,16 1,30

Изолейцин 6,01 11,93

Лейцин 10,64 18,37

Метионин 2,79 4,31