На страницу третьего семестра

Бутстреп-анализ и визуализация деревьев в пакете Phylip

Итак, консенсусное дерево, построенное программами, повторяет истинное с очень высокими бутстреп-значениями:

  +---------------------------C
  |
  |                    +------F
  |             +100.0-|
  |             |      +------E
  |      +-88.0-|
  |      |      |      +------B
  +------|      +-92.0-|
         |             +------A
         |
         +--------------------D


Ветви, вошедшие в консенсус.

ветвьЧастота встречаемости в 100 построенных деревьях
CDFEBA
..**.. 100.00
....** 92.00
..**** 88.00
Ветви, не вошедшие в консенсус.
ветвьЧастота встречаемости в 100 построенных деревьях
CDFEBA
..**.* 8.00
.*..** 7.00
.***.. 5.00
                                               
Вот неукорененное дерево,                                       
нарисованное drawtree:                                              
                                                                
                                                                                          
                                                    

А это дерево в виде филограммы:

На главную страницу третьего семестра


© Лукьянов Михаил, 2005