Информация о белке FMT_ECOLI из базы данных Pfam.

<<Второй семестр

Доменная структура FMT_ECOLI.

Здесь изображена доменная структура аминокислотной последовательности метионил-тРНК-формилтрансферазы кишечной палочки.

Домен	Идентификатор Pfam	Сокращённое название	Полное название и описание	Положение домена в последовательности
N-концевой	PF00551	Formyl_trans_N	N-концевой формилпереносящий домен. Осуществляет формилирование аминогруппы метионина, связанного с тРНК.	1-2 — 181-183
C-концевой	PF02911	Formyl_trans_С	N-концевой формилпереносящий домен. Содержит β-бочонок, видимо участвует в связвывании тРНК, так как в фермент-субстратном комплексе расположен на небольшом расстоянии от этой молекулы и в зоне контакта содержит в основном положительно заряженные остатки.	208 — 304

Здесь изображена 3D структура доменов метионил-тРНК-формилтрансферазы кишечной палочки (FMT_ECOLI). [PDB-файл 1fmt]

Семейство доменов, к которому относится N-концевой домен FMT_ECOLI.

Семейство включает в себя домены, участвующие в некоторых путях анаболизма.

• Глицинамид-рибонуклеотид трансформилаза катализирует 3-й этап биосинтеза пурина, перенос альдегидной группы на 5'-фосфорибозилглицинамид.

• Формилтетрагидрофолат деформилаза образует формиат из формилтетрагидрафолата.

• Метионил-тРНК-формилтрансфераза переносит альдегидную группу на N-конец метионина, входящего в состав метионил-тРНК.

• PSI-BLAST свидетельствует о близости к доменам данного семейства доменов белков HOXX_BRAJA, PRTH_PORGI, Y09P_MYCTU, функция которых неизвестна.

В общей сложности 642 белка содержат домен Formyl_trans_N.