Описание генома вируса Human coxsackievirus A20

По типу носителя генома вирус Human coxsackievirus A20 (идентификатор в базе данных EMBL: DQ358078) классифицируется как ssRNA positive-strand virus, то есть носителем информации является одноцепочечная РНК позитивной полярности. Последнее означает, что транслируется та РНК, которая входит в состав вируса. Также отсутствует ДНК стадия. Вирусы Коксаки типа A обычно инфицируют кожу и слизистые оболочки, вызывают острый геморрагический конъюнктивит, энтеровирусный везикулярный стоматит с экзантемой, заболевания верхних дыхательных путей и асептический менингит, а также заболевания горла (герпангина).

Геном данного вируса состоит из одной молекулы РНК. Эта молекула состоит из 7444 нуклеотидов. В геноме закодирован один ген. Информация о гене приведена в таблице 1.

Длина гена делится на 3. Графическое изображение всего гена вируса приведено на рисунке 1. На первом этапе синтезируется 1 полдипротеин, а затем он разрезается на обычные белки (показаны черным на рисунке 1). Первые кодоны гена приведены на рисунке 2. Рисунки получены с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov).