Пространственная структура AHBA synthase
Пространнственная структура белка, синтезирующего 3-амино-5-гидроксибензольную кислоту (AHBA synthase)
Главная

Пространственная структура синтазы 3-амино-5-гидроксибензольной кислоты (AHBA synthase) из генома бактерии Amycolatopsis mediterranei U32

Информация о белке была получена из базы данных PDB. Идентификатор записи 1B9H. На рис. 1 изображена третичная структура белка AHBA synthase. Cкрипт, с помощью которого можно получить то же графическое представление pdb-файла, что и на рис.1: скрипт Jmol . Для корректной работы файл с тексом скрипта должен иметь расширение “.spt”. Также необходимо указать путь к файлу в графе "load". Pdb-файл можно найти непосредственно в базе PDB или скачать по следующей ссылке: 1B9H.pdb .

Рис. 1. Третичная структура белка AHBA synthase. Белым цветом изображены α-спирали, а светло-синим - β-слои. Атомы кислорода молекул воды, окружающих белок, изображены в виде синих шариков. Шестичленный цикл серого цвета в центре изображения соответствует молекуле лиганда - 3-амино-5-гидроксибензольной кислоте. Изображение получено с помощью программы Jmol.

Инормация о белке AHBA синтазе, полученная из pdb-файла

Белок состоит из трех цепей. Координаты атомов были найдены с помощью метода ренгенструктурного анализа с разрешением два ангстрема. Также из pdb-файла можно узнать координаты атомов лигандов, не связанных ковалентно с молекулой белка. К таким молекулам относятся молекулы воды (216 экземпляров) и молекула 3-амино-5-гидроксибензольной кислоты. Информацию из pdb-файла можно посмотреть, скачав текстовый файл .

Обо мне
Ссылки


Valid HTML 4.01 Transitional