Поиск ортологов белка AHBA synthase

В базе данных RefSeq запись о белке AHBA synthase находится под названием YP_003762849.1. Для того чтобы узнать AC (Accession number, один из идентификаторов записи белка в Uniprot), я использовал сервис ID Mapping на сайте Uniprot. Для записи о белке AHBA synthase из организма Amycolatopsis mediteranei , штамм U32: ID D8HZ92_AMYMU, AC D8HZ92.

Вся информация в записях Uniprot распределена на поля, каждое со своим названием, состоящим из двух букв. Есть несколько способов получить нужную информацию из записи о белке. Например, открыть файл с записью с помощью команды less в командной строке bash , или же использовать grep с указанием метки поля и того, что она начинается в первой позиции (в моем случае grep ^XX d8hz92_amymu.entret , где XX - название нужного поля).

Ортологи белка - это те же белки из геномов других организмов. Для поиска ортологов моего белка в Uniprot я использовал расширенный поиск (Advanced Search). Запрос выглядит так:

name:"AHBA synthase" AND taxonomy:"Amycolatopsis"

Результат поиска - 6 последовательностей (см. рис. 1). Далее я выбрал записи из полностью секвенированных геномов ( Show only entries from a complete proteome set ). Число находок сократилось до 3, в их числе есть и исходная с AC D8HZ92. Для дальнейшей работы Было выбрано два с идентификаторами O52552 и T1UQX5. Информация о белках, полученная из записи о них в базе данных UniProt, а также с помощью других баз данных, представлена в таблице: inf_uniprot.xls.