GENSCAN

На вход программе GENCAN был подан фрагмент генома человека для получения информации об экзонах, находящихся в нем. Всего было обнаружено 2 гена, данные об экзонах в них представлены в таблицах 1-2.

Genome Browser

В геноме человека, сборка hg38 (Dec. 2013), был проведен поиск того же фрагмента по базе UCSC Genome Browser . В списке найденных фрагментов был выбран результат со 100%-ным сходством. Визуализация найденного фрагмента представлена на рис. 1. В полученном выравнивании были найдены примеры альтернативных донорных сайтов, а также касетных экзонов.

BLASTX

При помощи программы blastx был проаннотирован фрагмент из генома киви Actinidia chinensis . Использовалась база данных Swissprot , организмы viridiplantae и vitis vinifera . Графическое изображение получившихся результатов показано на рис. 2. Аннотация экзонов, полученная с помощью BLASTX, представлена в таблице 3.