| Главная |
Используя поисковую систему SRS, я получил список хромосом дрожжей Saccharomyces cerevisiae, приведенный в таблице 1.
| RefSeq_DNA (release) |
Accession |
Описание последовательности |
Длина последовательности |
| REFSEQ_DNA:NC_001133 |
NC_001133 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome I, complete sequence. |
230218 |
| REFSEQ_DNA:NC_001134 |
NC_001134 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome II, complete sequence. |
813184 |
| REFSEQ_DNA:NC_001135 |
NC_001135 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome III, complete sequence. |
316620 |
| REFSEQ_DNA:NC_001136 |
NC_001136 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IV, complete sequence. |
1531933 |
| REFSEQ_DNA:NC_001137 |
NC_001137 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome V, complete sequence. |
576874 |
| REFSEQ_DNA:NC_001138 |
NC_001138 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VI, complete sequence. |
270161 |
| REFSEQ_DNA:NC_001139 |
NC_001139 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VII, complete sequence. |
1090940 |
| REFSEQ_DNA:NC_001140 |
NC_001140 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome VIII, complete sequence. |
562643 |
| REFSEQ_DNA:NC_001141 |
NC_001141 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome IX, complete sequence. |
439888 |
| REFSEQ_DNA:NC_001142 | NC_001142 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome X, complete sequence. |
745751 |
| REFSEQ_DNA:NC_001143 |
NC_001143 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XI, complete sequence. |
666816 |
| REFSEQ_DNA:NC_001144 |
NC_001144 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XII, complete sequence. |
1078177 |
| REFSEQ_DNA:NC_001145 |
NC_001145 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIII, complete sequence. |
924431 |
| REFSEQ_DNA:NC_001146 | NC_001146 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XIV, complete sequence. |
784333 |
| REFSEQ_DNA:NC_001147 |
NC_001147 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XV, complete sequence. |
1091291 |
| REFSEQ_DNA:NC_001148 |
NC_001148 |
Saccharomyces cerevisiae S288c chromosome XVI, complete sequence. |
948066 |
Подробное описание XI хромосомы того же организма приведенно в таблице 2.
| Параметр |
Значение |
| № |
XI |
| Длина |
666816 |
| Количество генов
| 313 |
| Количество генов
| 16 |
Для данной хромосомы было выбрано 4 гена, а именно: ген, который находится на прямой цепи и не имеет интронов; ген, который находится на обратной цепи и не имеет интронов;
ген, который находится на прямой цепи и имеет хотя бы один интрон; ген, который находится на обратной цепи и имеет хотя бы один интрон. Информация о них приведена в таблице 3.
| Тип |
Ген |
Координаты |
| Ген, который находится на прямой цепи и не имеет интронов |
MCH2 |
6107..7528 |
| Ген, который находится на обратной цепи и не имеет интронов |
PAU16 |
complement(1810..2181) |
| Ген, который находится на прямой цепи и имеет хотя бы один интрон |
APE2 |
join(154991..155271,155655..158232) |
| Ген, который находится на обратной цепи и имеет хотя бы один интрон |
SFT1 |
complement(join(430198..430455,430597..430632)) |
С помощью сервиса idmapping на сайте uniprot были получены AC: D8HZ92 и ID: D8HZ92_AMYMU для белка с идентификатором RefSeq: YP_003762849.1.
Идентификатор в базе EMBL: CP002000.
Файл с последвательностью гена можно скачать по ссылке .
|