Шестой семестр
| Главная |
| Первый семестр |
| Второй семестр |
| Четвертый семестр |
Результаты упражнений
1.Поработаем в PyMOL с записью 1LMP банка PDB
Выберем мутацию, которая приведет к потере связывания с лигандом (Asn 103).
Мутация аспарагина на глицин (Gly 103)
2.Создадим анимационный ролик, где происходит совмещение белков и показывается место мутации.
movie.pse
3.Создадим поли-аланиновую последовательность в форме валентинки.
4.Напишем скрипт для построения поли-аланиновой альфа спирали длинной 100 аминкислот.
frag ala
python
for x in range(2,100):
cmd.edit("/ala///"+str(x)+"/c")
editor.attach_amino_acid("pk1","ala")
for x in range(3,100):
cmd.edit("/ala///"+str(x)+"/N","/ala///"+str(x)+"/CA")
cmd.torsion (82)
cmd.edit("/ala///"+str(x-1)+"/CA","/ala///"+str(x-1)+"/C")
cmd.torsion (178)
python end
| Главная | Шестой Семестр |