Здесь будет эмблема,извините за недоработку

Третий семестр
Главная
Первый семестр
Второй семестр
Третий семестр

сигналы в нуклеотидных последовательностях

Номер последовательностиA C G T
1 122 -982 64 -982 A,G
2 180 -982 -982 -982 A
3 22 -94 64 -37 A,G
4 -982 -982 223 -982 G
5 63 138 -982 -982 A,C
6 180 -982 -982 -982 A
7 180 -982 -982 -982 A
8 122 -94 -982 -37 A
9 -982 223 -982 -982 C
10 -982 -982 223 -982 G
11 -136 -982 6 122 G,T
12 -982 -982 -982 180 T
13 -982 -982 -982 180 T
14 -37 -94 106 -37 G
15 -982 223 -982 -982 C
16 -136 -94 186 -982 G

Найденные мотивы

NAME 	STRAND 	START 	P-VALUE 	SITES
purM 	- 	21 	4.60e-10 	TCTAACAGGG 	AAAGCAAACGTTTGCG 	AGACTGCTTT
cvpA 	- 	29 	1.83e-09 	TCTAACAGAA 	AAAGAAAACGTTTGCG 	TAGGGATTTC
purE 	- 	14 	5.16e-09 	GAAAGAGAGC 	AAGGAAAACGGTTGCG 	TGGCTGTGAA
pyrC 	+ 	32 	1.21e-08 	TTTTCGTGCA 	AAGGAAAACGTTTCCG 	CTTATCCTTT
codB 	- 	18 	2.78e-08 	CTGAAGATAA 	AAAGCAATCGTTTTCG 	TGGGGAAATA
purR 	+ 	38 	4.40e-08 	AAGGTGTGTA 	AAGGCAAACGTTTACC 	TTGCGATTTT
purL 	- 	9 	7.63e-08 	CTGATGCGCT 	GACGAAACCGTTTGCG 	TGGAAATAA
guaB 	+ 	30 	1.30e-07 	AAAAGGGGTA 	GATGCAATCGGTTACG 	CTCTGTATAA
glnB 	+ 	16 	3.38e-07 	ACACGAGCTG 	GATGCAAACGATTTCA 	AGGAATGAAT

Исходные последовательности

>codB
(предсказанный)aaaaaatatatttccccacgaaaacgattgctttttatcttcagatgaatagaatgcggcggattttttgggtttcaaacagcaaaaagggggaatttcg
(реальный     )aaaaaatatatttccccacgaaaacgattgctttttatcttcagatgaatagaatgcggcggattttttgggtttcaaacagcaa
>purE
(предсказанный)tgatttcacagccacgcaaccgttttccttgctctctttccgtgctattctctgtgccctctaaagccgagagttgtgcaccacaggagttttaagacgc
(реальный     )tgatttcacagccacgcaaccgttttccttgctctctttccgtgctattctctgtgccctctaaagccgagagttgtgcaccaca
>pyrC
(предсказанный)agggcgcattcgcgccctttatttttcgtgcaaaggaaaacgtttccgcttatcctttgtgtccggcaaaaacatcccttcagccggagcatagagatta
(реальный     )agggcgcattcgcgccctttatttttcgtgcaaaggaaaacgtttccgcttatcctttgtgtccggcaaaaacatcccttcagcc
>purR
(предсказанный)ggcgtaccgcaacacttttgttgtgcgtaaggtgtgtaaaggcaaacgtttaccttgcgattttgcaggagctgaagttagggtctggagtgaaatggaa
(реальный     )ggcgtaccgcaacacttttgttgtgcgtaaggtgtgtaaaggcaaacgtttaccttgcgattttgcaggagctgaagttagggtc
>cvpA
(предсказанный)tttattgatgcgcgggaaggaaatccctacgcaaacgttttctttttctgttagaatgcgccccgaacaggatgacagggcgtaaaatcgtgggacacat
(реальный     )tttattgatgcgcgggaaggaaatccctacgcaaacgttttctttttctgttagaatgcgccccgaacaggatgacagggcgtaa
>purM
(предсказанный)aaaggttgtgtaaagcagtctcgcaaacgtttgctttccctgttagaattgcgccgaattttatttttctaccgcaagtaacgcgtggggacccaagcag
(реальный     )aaaggttgtgtaaagcagtctcgcaaacgtttgctttccctgttagaattgcgccgaattttatttttctaccgcaagtaacgcg
>guaB
(предсказанный)gatagcaagcattttttgcaaaaaggggtagatgcaatcggttacgctctgtataatgccgcggcaatatttattaaccactctggtcgagatattgccc
(реальный     )gatagcaagcattttttgcaaaaaggggtagatgcaatcggttacgctctgtataatgccgcggcaatatttattaaccactctg
>glnB
(предсказанный)ttcccgacacgagctggatgcaaacgatttcaaggaatgaattggcgttatgtgttacgtttagcagatcaaaagacaggcgaccttttcaaggaatagc
(реальный     )ttcccgacacgagctggatgcaaacgatttcaaggaatgaattggcgttatgtgttacgtttagcagatcaaaagacaggcgacc
>purL
(предсказанный)ttatttccacgcaaacggtttcgtcagcgcatcagattctttataatgacgcccgtttcccccccttgggtacaccgaaagcttagaagacgagagactt
ttatttccacgcaaacggtttcgtcagcgcatcagattctttataatgacgcccgtttcccccccttgggtacaccgaaagctta
>purA
(не предсказан)aaaacagactgatcgaggtcatttttgagtgcaaaaagtgctgtaactctgaaaaagcgatggtagaatccatttttaagcaaacggtgattttgaaaaa
(реальный     )aggtcatttttgagtgcaaaaagtgctgtaactctgaaaaagcgatggtagaatccatttttaagcaaacggtgattttgaaaaa
>folD
tcacgcgataaatctgaaacgaaacctgacagcgcgccccgcttctgacaaaataggcgcatccccttcgatctacgtaacagatggaatcctctctctg

>rpiA
tattttatggatgagttaaccacgcggcttgccaacggggtctgaatcgctttttttgtatataatgcgtgtgaaatttcataccacaggcgaaacgatc

>carA
tttgccagaaattcgtcggtaagcagatttgcattgatttacgtcatcattgtgaattaatatgcaaataaagtgagtgaatattctctggagggtgttt

>pdhR
cctgtatggacataaggtgaatactttgttactttagcgtcacagacatgaaattggtaagaccaattgacttcggcaagtggcttaagacaggaactca

>fixA
tgaaagttggatttatctgcgtgtgacattttcaatattggtgattaaagttttatttcaaaattaaagggcgtgatatctgtaattaacaccaccgata

>rbsD
gtttttgttttcatggttaatcaccatgtaaaacgtttcgaggttgatcacatttccgtaacgtcacgatggttttcccaactcagtcaggattaaactg

Сравнение результатов

Все сайты предсказаны почти верно(смещение на 1 нуклеотид) 1 сайт не предсказан.
Правильно предсказано 9
Всего предсказанных 9
Всего правильных 10
Чувствительность = правильно предсказанных / всего правильных = 9 / 10 = 0.9 Специфичность = правильно предсказанных / всего предсказанных = 9 / 9 = 1
Главная Второй Семестр